既存のテーマを継承した子テーマを作ることができるらしいのでやってみた。

TwentyTwelveをベースにカスタマイズするとした場合、次の事をする。

themeフォルダに新規テーマのディレクトリを作成する。

１．style.cssを作成する。
２．次の内容を書く
/*
Theme Name: [テーマの名前]
Author: [あなたのお名前]
Description: TwentyTwelveのカスタマイズ版.
Version: 1.0
Template:twentytwelve
*/

@import url(../twentytwelve/style.css);

３．twentytwelveのscreenshotをコピーして持ってくる。

ベースはこれで出来上がり、管理画面のテーマから選択することができるようになったはずです。

あとはカスタマイズしたいファイルをコピーして持ってきて編集すればOKらしいです。
ただ、functions.phpは子テーマ.functions.php　→　親テーマ.functions.phpを実行するらしいので
関数名のオーバーライドは不可という事らしいです。